Résumé
Introduction : Les infections respiratoires virales sont une cause majeure de morbidité et de mortalité dans le monde. Les virus sont impliqués dans plus de 80 % des infections respiratoires. Objectifs : L’objectif de cette étude était d’analyser l’épidémiologie des virus respiratoires et d’évaluer l’impact de la pandémie de COVID-19 sur leur circulation entre 2019 et 2023. Matériels et méthodes : Cette étude descriptive rétrospective et prospective a été menée au Laboratoire de Virologie de l’Hôpital Militaire d’Instruction Mohammed V à Rabat, au Maroc, de septembre 2019 à avril 2023. Les échantillons ont été prélevés chez des patients hospitalisés pour infection respiratoire aiguë, dont le test PCR SARS-CoV-2 était négatif, et ont subi un test PCR multiplex respiratoire à l’aide du kit BioFire® Respiratory 2.1 sur un prélèvement nasopharyngé. Les données démographiques ont été extraites du système d’information du laboratoire. L’analyse statistique a été réalisée avec SPSS 22.0 et Microsoft Excel. Résultats : Un total de 1 050 tests PCR a été effectué. Le taux de positivité était de 54 % (564 patients). L’âge médian des patients avec un test PCR positif était de 31 ans (1-91 ans). Le ratio homme/femme était de 1,52. Les taux de positivité étaient respectivement de 57 %, 53 %, 72 %, 52 % et 44 % au cours des années 2019 (septembre à décembre), 2020, 2021, 2022 et 2023 (janvier à avril). Parmi les virus détectés, l’Enterovirus/Rhinovirus était le plus fréquent (50 %), suivi du virus Influenza (16 %) et du virus respiratoire syncytial (11 %). Quatre cent cinquante PCR positifs correspondaient à des mono-infections (80 %), tandis que 114 (20 %) étaient des co-infections, dont 108 impliquant deux virus et 6 impliquant trois virus. Conclusion : La mise en place et la levée des mesures barrières liées à la pandémie ont significativement influencé la circulation des virus respiratoires, en accord avec les schémas saisonniers. Dans notre contexte, le dépistage de l’Enterovirus/Rhinovirus et de la grippe est recommandé en priorité chez les adultes, tandis que celui de l’Enterovirus/Rhinovirus et du VRS est recommandé en premier chez les enfants. Par ailleurs, le test multiplex devrait être envisagé pour les cas sévères ou présentant des facteurs de risque.
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